Dal 24 maggio 2018 Little Nightmares Complete Edition sarà disponibile per Nintendo in versione retail (dal 18 maggio in digitale su Nintendo e-Shop). Il gioco è stato adattato per la console ibrida di Nintendo, con una risoluzione di 720p (upscalata) e 30 FPS per la modalità portatile e 720p (nativi) e 30 FPS per la modalità TV, oltre all'aggiunta del supporto dell'HD rumble.
Little Nightmares Complete Edition includerà anche i bonus pre-order della versione console, come le maschere "teiera rovesciata" e "sacco per spaventapasseri". Inoltre, saranno incluse anche tutte le storie aggiuntive dell'espansione The Secret of the Maw. Queste storie indipendenti saranno giocabili con salvataggi separati per Six e il Fuggiasco. I giocatori potranno impersonare i due protagonisti indossando un'esclusiva maschera Pakku, che sarà disponibile nel menu Extra una volta scannerizzato l'amiibo di Pac-Man.